mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGCCAAGGATGACTTGCCGA GGCAAGTTGTGTTTGGCTACA GATATTATGGTGCAGCCAAGGATGACTTGCCGAAAATAATTTGCTCGATCGTTAATGTGCTTCTCCAGTTTCTATTGCAATTTATGCATAGGGCAATATATATATCCTTTATAGCTTGTTAATTCAGATATTGACTGAGGAATCAATAATGGGCAAGTTGTGTTTGGCTACATGTTTATCTCAT 6 0 5' arm Vitis_vinifera pmrd MIR169_2 6e-100 vvi-MIR169f 8e-102 -47.59 ((((.((((....(((((((.(..(((((((.........((((((.(((((.....(((................)))....))).)).))))))........(((((........((((((......)))))).)))))..........)))))))..).))))))).))))..)))).... (-47.59)