mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGCCAAGGATGGCTTGCCG GAGGGTTATCCTTGACTCCTT AGGGTGGAATTGAGCCAAGGATGGCTTGCCGTCCTTTGTCACTATTTGAGGCATTAACTGGTCACGCACGGAGGGTTATCCTTGACTCCTTTAGCTCCTCT 4 0 5' arm Vitis_vinifera pmrd MIR169_2 2e-51 vvi-MIR169h 1e-52 -34.9 .((((..((..(((.(((((((((((..((((....(((.((((.((((....)))).)))).))).))))..))))))))))).)))..)).)))).... (-34.90)