mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GAGCCAAGGATGACTGGCCGT GGCTGGTTATCCCTGTCTCCT AGGGTGGAATTGAGCCAAGGATGACTGGCCGTCATTTTTCAGTTGGTATTTGAGGCTTTAACTGGTCATGCACGGCTGGTTATCCCTGTCTCCTTTAGCTCCTCT 4 0 5' arm Vitis_vinifera pmrd MIR169_2 2e-46 vvi-MIR169i 6e-55 -40.6 .((((..((..(((.((.(((((((..((((((((...((((((((...........))))))))..))).)))))..))))))).)).)))..)).)))).... (-40.60)