mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GAGCCAAGGATGACTTGCCGT GGCTAGTTATTCTTGGCTCAT AGGGTGGAATTGAGCCAAGGATGACTTGCCGTCCTTTGCATCAAGCATTGAAGCTTTAACTGGGCATGCACGGCTAGTTATTCTTGGCTCATTTGGCCCCTCT 1 0 5' arm Vitis_vinifera pmrd MIR169_2 2e-27 vvi-MIR169l 9e-54 -50.1 .((((.((((.(((((((((((((((.(((((.(..(((.....)))..)..((((.....))))....))))).))))))))))))))))))).)))).... (-50.10)