mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GAGCCAAGGATGACTTGCCGC CAGCGAGTTATTCTTGGCTCAT AGGGTGGATTTGAGCCAAGGATGACTTGCCGCCATCAGCAGCAAGCATTGAAGCTTTAACTGGGCATGGACAGCGAGTTATTCTTGGCTCATGCGGCCCCTCT 1 1 5' arm Vitis_vinifera pmrd MIR169_2 6e-49 vvi-MIR169o 9e-54 -51.7 .((((.(...(((((((((((((((((((.((((((..(((.((((......))))...))).).)))).).)))))))))))))))))))..).)))).... (-51.70)