mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGTCAAGGATGACTTGCCG GCAAGTTGACTTGACTCAGT AGGGTGGAATTGAGTCAAGGATGACTTGCCGATATATATTTGCAGAAGGCATGCAGGGGCTTTTAGCTATGTGTAACCGGCAAGTTGACTTGACTCAGTTTGGCCCTCT 2 1 5' arm Vitis_vinifera pmrd MIR169_2 4e-56 vvi-MIR169r 3e-57 -56.1 (((((.(((((((((((((...(((((((((.(((((((..((.((((((........)))))).)).)))))))..)))))))))..))))))))))))).))))).. (-56.10)