mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAGCCAAGGATGAATTGCCGG GGCAATTTATTTCTTGGCTATG AGGGAGGAACAAAGCCAAGGATGAATTGCCGGCGATGAAAGTAGGCAGCTTTGTCCATGGATCGGCAATTTATTTCTTGGCTATGTTGGGCTCTCT 1 1 5' arm Vitis_vinifera pmrd MIR169_2 2e-48 vvi-MIR169v 1e-49 -42.2 ((((((.((((.(((((((((((((((((((((.((((((((.....)))))...))).).))))))))))).))))))))).))))...)))))) (-42.20)