mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGCCAAGGATGACTTGCCGG GGCGAGTCATTCTTAGCTACA GGTTATGTGGTGCAGCCAAGGATGACTTGCCGGCAACTCCCTTTATTGTACTCATGCATGCTCATACTTATACTGTTGTGGGCATCATTTAAGTGGCAAAAATGGTGGTCGGCGAGTCATTCTTAGCTACATTTCTGCCTCAT 2 0 5' arm Vitis_vinifera pmrd MIR169_2 1e-75 vvi-MIR169w 2e-77 -57 (((...(..(((.(((.(((((((((((((((((....((.(((.(((((((.(((.((((((((((.......).))))))))))))...))).))))))).))..))))))))))))))))).))).)))..).))).... (-57.00)