mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCCAAGGATGACTTGCCTA GGCAGTCATTCCTTCGGCTAAA GTCTCGTCTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTAAATCCACCAGGTTTCAAAACACTGAATGTAATTATCCACAAAGCGATTCCGTGGTCTTTAGGCAGTCATTCCTTCGGCTAAACTGACCGGCTC 0 3 5' arm Vitis_vinifera pmrd MIR169_5 1e-65 vvi-MIR169x 8e-67 -42.7 (((..(((...(((((((((((((((.(((((((.((((((((((....))).)))..(((........)))..........))))..)))))))))))).))))).)))))....))).))).. (-42.70)