mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGAGCCGTGCCAATATCACG GGATATTGGTGCGGTTCAATA TGGTATTACGGGATATTGGTGCGGTTCAATAAGAAAGCAGTGCTCGCAATCTTTTTGAGTTCTGGTTTTTGATTGAGCCGTGCCAATATCACGTGTCATTGCT 3 0 3' arm Vitis_vinifera pmrd MIR171_1 4e-50 vvi-MIR171c 9e-54 -48 .((((.((((.((((((((..(((((((((.(((((.(((.(((((.((....))))))).))).))))).)))))))))..)))))))).))))....)))) (-48.00)