mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGAGCCGCGCCAATATCACT CGATGTTGGTGAGGTTCAATC TTGAAGAAAGCGATGTTGGTGAGGTTCAATCTGAAGATTGATTTATGCTTGAATGTAAAAACTGATCTCAGATTGAGCCGCGCCAATATCACTTTTCTGTGGC 2 0 3' arm Vitis_vinifera pmrd MIR171_1 2e-51 vvi-MIR171f 9e-54 -45.9 .....(((((.((((((((((.((((((((((((.((((..(((.(((......))).)))..)))))))))))))))).)))))))))).)))))....... (-45.90)