mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATTGGACTGAAGGGAGCTCCC GAGCTCCTTTTAGTCCAATAA GAACAGCTGAAGAGCTCCTTTTAGTCCAATAAAGAGGGCTGAGGGGCGGCCAGAGCTGCCATCTCATGCACTTGGCTATGCTTATTCTTTTCTCAATCAATTCGGTTCGAGTATGGCTGTGGAGTGACAAATGCTAAGTTTAGCCTGATGCATGACATGGGAGCAACTCCTCCGCACGCTTTGCCCACTCATTGGACTGAAGGGAGCTCCCAGGGCAGATCT 2 0 3' arm Vitis_vinifera pmrd MIR159 4e-123 vvi-MIR319g 2e-124 -96 .....(((...(((((((((((((((((((..((.((((.(((.(((((..((.(((.((((.(((((((...(((((.(((((.((.((((.((..(((((((...))))).))..)).)))).)).......))))).)))))...))))))).)))).)))..))...)))).).))).)))).)).)))))))))))))))))))....)))...... (-96.00)