mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCCAAAGGGATCGCATTGATCC ATCATGCTATCCCTTTGGATT GGAGGAGGCATCCAAAGGGATCGCATTGATCCCAAACTCTCCATGTCTTTGGATCATGCTATCCCTTTGGATTCCTCCTTTGG 1 1 5' arm Vitis_vinifera pmrd 100 vvi-MIR393b 6e-42 -45.7 ((((((((.((((((((((((.((((.(((((.(((..(.....)..)))))))))))).)))))))))))).)))))))).. (-45.70)