mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTGAAGTGTTTGGGGGAACTC GTTCCCTTGACCACTTCACTG GTCCCCTAGAGTTCCCTTGACCACTTCACTGGGGACCTTCTCTAATTATAATGACTTCCTACTGAAGTGTTTGGGGGAACTCCTGGTGCTAT 4 0 3' arm Vitis_vinifera pmrd mir-395 5e-46 vvi-MIR395h 3e-47 -37.5 (..((...(((((((((..(.(((((((.((((((...((............)).)))))).))))))).)..)))))))))..))..)... (-37.50)