mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTGAAGTGTTTGGGGGAACTC GTTCCCTTGAACACTTCACTG GTCCCCTAGAGTTCCCTTGAACACTTCACTGGGGACCTTCTCTAGTTATAATGACTTCCTACTGAAGTGTTTGGGGGAACTCCTGGTGCCAT 3 0 3' arm Vitis_vinifera pmrd mir-395 2e-39 vvi-MIR395m 3e-47 -42 ....((..(((((((((..(((((((((.((((((...((..((....))..)).)))))).)))))))))..)))))))))..))...... (-42.00)