mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTGAAGAGTCTGGAGGAACTC GTTCCCCCAACCCCTCCAGTA GGCCTTGAGAGTTCCCCCAACCCCTCCAGTATGACCATCTCTCTTCTTCTTTTAATTTGTTCATCAAATCTTCTTCTACTATCTATTTCCAGGGTGATTTCCTCTACTGAAGAGTCTGGAGGAACTCTTGGTGCCAC 5 0 3' arm Vitis_vinifera pmrd 100 vvi-MIR395n 6e-74 -37 (((.(..((((((((.(((..(.((.(((((.......................(((((.....))))).....................((((.....)))).))))).)).)..))).))))))))..).))).. (-37.00)