mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCACAGCTTTCTTGAACTG GCTCAGGAAAGTTGTGGAACA TTCTGTGATCTTCCACAGCTTTCTTGAACTGTTTTGGAAGCCTTCCACTTCCATGCAATGGAGGAGTTCAACCAACAGCTCAGGAAAGTTGTGGAACATTACTGAGAG 1 0 5' arm Vitis_vinifera pmrd MIR396 7e-55 vvi-MIR396c 1e-56 -48 (((.(((((.(((((((((((((((((.((((((((((..(((.(((...........))))))..)))))..))))).))))))))))))))))).))))).))).. (-48.00)