mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTAGATTCACGCACAAACTCG AGTTTGTGCGTGAATCAAACC GCACATCTCAAGTTTGTGCGTGAATCAAACCCCATCGTAGCCGTCCATATCTTCGGGTACTAATCACGGGGCGATTCGACGCCGTTAGATTCACGCACAAACTCGTGATCTGTCC 2 0 3' arm Vitis_vinifera pmrd MIR403 7e-55 vvi-MIR403c 7e-61 -45.2 (((.(((.(.((((((((((((((((.(((..(.(((.(..(((((.((((....)))).........)))))..)))).)..))).)))))))))))))))).).))).))).. (-45.20)