mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTAGATTCACGCACAAACTCG AGTTTGTGCGTGAATCAAACC GCACATCTCAAGTTTGTGCGTGAATCAAACCCCATCGTAGCCGTCCATATCTTCGTGTACTAATCACGGGGCGATTCGACGCCGTTAGATTCACGCACAAACTCGCGATCTGTCC 2 0 3' arm Vitis_vinifera pmrd MIR403 4e-50 vvi-MIR403e 7e-61 -44.31 (((.(((.(.((((((((((((((((.(((..(.(((.(..(((((.......((((.......)))))))))..)))).)..))).)))))))))))))))).).))).))).. (-44.31)