mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCTACTCCTCCCATTCC AATTGGAGAGTAGGAA AATGTTTGGGAATTGGAGAGTAGGAAAGCTTAGCCATCTATTCCCTTCATGGTTTCCTCTCCATGGATTGGGGGTCTAGAGCTAGTCTTTCCTACTCCTCCCATTCCTATTGTTTTC 1 1 3' arm Vitis_vinifera pmrd 100 vvi-MIR482 5e-62 -51.8 ......(((((((.((((((((((((((.(((((..((((..((((((((((........))))))....))))..))))))))).)))))))))).)))).)))))))........ (-51.80)