mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTTGGATTGAAGGGAGCTCCT GAGCTCCCTTCGATCCAATCC GAAGAGCTCCCTTCGATCCAATCCAGGAGGGGAAGTGGTCGGTTGCAGCTGCCGGTTCATGGATACCTCTCTGGTGCAGCAATGGCCGCTGCTCACCTCTGCACTTGCATGGGTGTGCATGACCCGGGAGATGAGCCCGCCATCATCTTTCCCTCGTGCTTGGATTGAAGGGAGCTCCTC 2 0 3' arm Zea_mays pmrd MIR159 3e-98 zma-MIR159c 2e-99 -101.8 ((.((((((((((((((((((..((.(((((((((((((.((((.((.((.((((.(((((.((((((....(((((((...((((....)).))...))))))).....)))))).))))).)))).)).)))))).))))....))))))))).)).)))))))))))))))))).)) (-101.80)