mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCC GAATGTTGTCTGGTTGGAGA GGGGAATGTTGTCTGGTTGGAGACCTAACACCRCGAATTAATCATCCATGCCATGGAAGCAGCATATGCCCGCCTGCATCTATCCATGCATGATGGTGGAAGGTTTCGGACCAGGCTTCATTCCCC 3 0 3' arm Zea_mays pmrd mir-166 0.00000000002 zma-MIR166g 1e-66 -62.2 ((((((((..((((((((.(((((((..((((........(((((.((((..(((((.(((((........).)))).))))).)))).)))))))))..))))))).))))))))..)))))))) (-62.20)