mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCTC GGAATGGAGGCTGGTCCAAGA AAAGAACGGGAGGAGGGTTTCTGGAATGGAGGCTGGTCCAAGATCCTTAGGTGTTAAAGCATTATATTGCCTTGTTTCTGGTTTTGTGTTTGAGATCTCGGACCAGGCTTCATTCCTCAAACCCACGCTCCCGACAC 4 0 3' arm Zea_mays pmrd mir-166 0.000002 zma-MIR166l 6e-74 -64.9 ......(((((((.((((((..(((((((((.(((((((.(((((.....((((....))))((((..(((........)))..)))).....))))).))))))).)))))))))..)))))).).)))))).... (-64.90)