mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCCC GGAATGTTGTCTGGCTCGAGG TTGAGGGGAATGTTGTCTGGCTCGAGGTGCAGAAACATACAGATCTCATCGGTCTAGGTTCTTGTCGATCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTCAA 4 0 3' arm Zea_mays pmrd mir-166 2e-45 zma-MIR166e 3e-44 -49.3 .(((((((((((..((((((..(((((((((..(((....(((((.....)))))..)))..)))..))))))..))))))..))))))))))). (-49.30)