mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCCC GGAATGTCGTCTGGCGCGAGA GGGGAATGTCGTCTGGCGCGAGACCGTACCAGACGACGTGCTCTCTCGGTCGTCGGACGGTCTCGGACCAGGCTTCATTCCCC 2 2 3' arm Zea_mays pmrd mir-166 1e-40 zma-MIR166i 6e-42 -53.1 ((((((((..(((((((.(((((((((.((.((((((...........)))))))))))))))))).))))))..)))))))) (-53.10)