mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCACGCTTCATTCCCC GGAATGTTGTCTGGTTGGAGA GTGGAATGTTGTCTGGTTGGAGACCTAACACCGCGAATCCCTTATCCATGCCATGGAAGCAGCATATGCCCGCCTGCATCTATCCATGCATGATGGTGGAAGGTTTCGGACCACGCTTCATTCCCC 6 0 3' arm Zea_mays pmrd mir-166 0.0000000001 zma-MIR166g 4e-53 -50.3 ..((((((..((.(((((.(((((((..((((..(.....).....(((((.(((((.(((((........).)))).....))))))))))..))))..))))))).))))).))..)))))).. (-50.30)