mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAGCTGCCAGCATGATCTA GATCATGCATGACAGCCTCATT TGCTCTTGCGAATGAGTGAAGCTGCCAGCATGATCTAGCTCTGATTTGGTTGGCACCATATTAGCAGGCGTCCACGCACAGCTAGACTAGAGTGGCCTCGCGCGCTCTCGTCTGGTCTGTGTCTCGCTTTGTGCCTGCAAATCGTTGTTAGATCATGCATGACAGCCTCATTCCTTCACAATTCTGGGGC 2 1 5' arm Zea_mays pmrd MIR167_1 8e-16 zma-MIR167a 2e-105 -88.2 .(((((((.(((.((((((.((((.((((((((((((((..(((((((...(((((.........(((((.....((((((((((((.((((((((...)).)))))).)))))).))))))..))))).)))))..)))))))..)))))))))))).)).)))).)))))).))).)).....))))) (-88.20)