mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAGCTGCCAGCATGATCTG GATCATGTTGCAGCTTCACT ACTTCGCTGGTGTGAGAGCTTGAAGCTGCCAGCATGATCTGGCTACTCAAACGCCGCCGGCCTCCCAAGTGCTCGATCGGTGGCGCTTCACCAGATCATGTTGCAGCTTCACTCTCTCGCAACCAGCGAA 0 1 5' arm Zea_mays pmrd MIR167_1 9e-58 zma-MIR167i 1e-68 -76.74 ...(((((((((((((((..(((((((((.((((((((((((.........((((((((..(............)..)))))))).....)))))))))))))))))))))..))))))).)))))))). (-76.74)