mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAGCTGCCAGCATGATCTA GCAGATCTCAGTTTGGTAGCTTCTTC GAGTTTGCAGATCTCAGTTTGGTAGCTTCTTCTATTCCACTGGCCATCACTTGCTTTGATTTCTTCCGTTTCTTATAGGTTGTACAACTTTCTGTTCTTTGGATCTGAGATTGAATAATCACTCATCTACACCTAGTCATGGTATTTTATGCAACATGTTCTAGCTAGCCTGGAACTGCCTGCTCAAGGGAACGAGTGAAGCTGCCAGCATGATCTAGCTC 3 5 3' arm Zea_mays pmrd MIR167_1 0.0000000000002 tae-MIR167 0.00000000000001 -59.45 (((((...(((((...(((.((((((((((((..((((....(((((.(((...((..(((((.((((......(((((..(.....)..)))))....))))...)))))..))...................))).))))).......(((.((.(((((((.....)))))))))..)))....))))..))).))))))))))))..)))))))))) (-59.45)