mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAGCTGCCAGCATGATCTA GATCATGCTGTGGCAGCCTCACT GAGTGAAGCTGCCAGCATGATCTAGCTCGGAGTGATCACGCGAGGAGAACAATAGCTCGAGGTGGTCATGCCTTGCTAGATCATGCTGTGGCAGCCTCACTT 1 2 5' arm Zea_mays pmrd MIR167_1 6e-52 zma-MIR167c 4e-53 -60.8 ((((((.(((((((((((((((((((..((.((((((((.((((...........))))..)))))))).))..))))))))))))..))))))).)))))) (-60.80)