mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAGCTGCCAGCATGATCTA GATCATGCTGTGGCAGCTCACT GAGTGAAGCTGCCAGCATGATCTAGCTCGGAGTGATCACGCGAGGAGACATAGCTCGAGGTGGTCATGCCTTGCTAGATCATGCTGTGGCAGCTCACTT 0 3 5' arm Zea_mays pmrd MIR167_1 8e-39 zma-MIR167c 5e-40 -60.4 ((((((.(((((((((((((((((((..((.((((((((.((((.........))))..)))))))).))..))))))))))))..))))))))))))) (-60.40)