mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAGCTGCCACATGATCTG GATCAGGCTGGCAGCTTCA TGAAGCTGCCACATGATCTGATGACGCAGAGTCATGCATATGCATTGCATCCAGCAAGCTCCATGCGTGCGTGCATGGCCGAATGGCCGAAGAGACTAGCTAGTCCATCTCTCCAAGGCCATCCACGTGTGAGAATTCAATTCCTCGTGGATCAGATCAGGCTGTTGTTGACAACTGCATGCCGCACCTGCACTACAGCAACCCAAGGCATAGGTAGCTAGCTAGGTTTCGGTGGTCAGATCAGATCAGGCTGGCAGCTTCA 3 1 5' arm Zea_mays pmrd MIR167_1 0.0002 zma-MIR167f 0.0002 -108.01 .((((((((((..((((((((((((...(.(((((((((..((((.((((..((....))..)))))))))))))))))).....(((((((...(((((((((.....((..((((((((((((((.(.(((.......)))).))))))).......)))).)))..))..(((..(((((.....(((......)))......))))).))).))))))))).))))))).))))..))))))))...)))))))))). (-108.01)