mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGCTTGGTGCAGATCGGGAC CCCGCCTTGCACCAAGTGAAT GAAGCCGCGCCGCCTCGGGCTCGCTTGGTGCAGATCGGGACCCGCCGCCCGGCCGACGGGACGGATCCCGCCTTGCACCAAGTGAATCGGAGCCGGCGGAGCGA 3 0 5' arm Zea_mays pmrd MIR168 6e-52 zma-MIR168a 2e-54 -65.7 ...((..(((((.(((.(..(((((((((((((..(((((.(((...((((.....)))).))).)))))..)))))))))))))..).))).)))))..)).. (-65.70)