mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA GCGTGCGAGGAGCCATGCATA TCTATCATGTATGCCTGGCTCCCTGTATGCCATTTGCTTAGTCCATTTAGTATTAGATGGCCTTTGTGGATGGCGTGCGAGGAGCCATGCATATTGTTGTG CATGAAATTAGCTGAGTTTTATAGCTAAGTCAAGAGAAAGAGCTTCCCCCCCCACCAAAAGTAGAAAATTAGAAATGTTGTGAAGAGTTGATGAAGGTGCCAAAGCAAAAGGTAGTTTTGTTTGTGAAAGCAGAAGCTTGTGGGGCATACCAATTCATTTCATATGCACTTTAGACTCTTTGAGAGAGTTGATTTGATTTTCAATTAAAGCTTCTTTCTCCCTTTCTTGAATAGATATATACTTGATTCAAGTCCTCTCCAGCTTCTTCACTCTCCACACATTACTATATTACTTCTTCTTATAAGTTTGGTGGTCCTTAGCTTCTCTTCAGCAAGCTAAGGTAACTAGCTATAATGGAGTTGTGGATTTTCTTCCTTCTTGCTACTTTCTTGATGATGGTGAAGTAAGTTATAAAGAGAGATGTTGGTGTTTGATTAATTACACACACATATATATGTAGCTAGCTAGCGCTACATGCATAAGTGCTCTATCATGTATGCCTGGCTCCCTGTATGCCATTTGCTTAGTCCATTTAGTATTAGATGGCCTTTGTGGATGGCGTGCGAGGAGCCATGCATATTGTTGTGCATGTTGTATACTATATGTTGTTGTGATTATATCACCAACCCTCTTTCAGCTCCCTCTCTCTCTCATTTTATTATTTCAGAGTATAATTTGATGCTTTAGTTAATTGTGTTTTAGATGTGAAGAATTTTGTATATGACAAGCTAGAATAATGAAGAATTTCCTATGACTTGACAGTTTGTTTGACTTATTGATTCATT 2 0 5' arm Aquilegia_formosa_x_Aquilegia_pubescens mirnest mir-160 0.00000000002 aqc-MIR160b 3e-41 -46.6 .....((.((((((.(((((((.((((((((((((((..((.(((((((....))))))).))..)))))))))))))).))))))).))))))...)).. (-46.6)