mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGCTTGGTGCAGATCGGGAC CCCGCCTTGCATCAAGTGAAT TCCGCCGCGCCGTCTCGGGCTCGCTTGGTGCAGATCGGGACCCGCCGCCCGGCCGACGGGACGGATCCCGCCTTGCATCAAGTGAATCGGAGCCGGCGCAGCGA 3 0 5' arm Zea_mays pmrd MIR168 4e-44 zma-MIR168b 2e-54 -68.9 ..(((.((((((.(((.(..(((((((((((((..(((((.(((...((((.....)))).))).)))))..)))))))))))))..).))).)))))).))). (-68.90)