mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGCCAAGGATGACTTGCCGA GGCAAGTTGTTCTTGGCTACA TAGGCTCGGGGACTATGGTGCAGCCAAGGATGACTTGCCGATCGATGTGACGCCTCTTGATCTCGTCGTCGTCAGATCGTCGCCGATCATCGGCAAGTTGTTCTTGGCTACACCGTGGCTCCTGCTCCTG 3 0 5' arm Zea_mays pmrd MIR169_2 0.00000000003 zma-MIR169a 9e-70 -72.6 ((((..((((..((((((((.(((((((((..(((((((((..(((((((((...........))))).)))).(((((....))))).)))))))))..))))))))).))))))))..))))..)))) (-72.60)