mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGCCAAGGATGACTTGCCGA GGCAAGTTGTTCTTGGCTACA TAGGCTCGGGGACTACGGTGCAGCCAAGGATGACTTGCCGATCTATCGTCGATCAACGAGCGACGCCTCTGATGTCTGATCTCGACATCTATCGTCGTCAGACCATCATCATCTATCGGCAAGTTGTTCTTGGCTACACCGTGGCTCCTGCTCCTG 3 0 5' arm Zea_mays pmrd MIR169_2 0.00000000004 zma-MIR169b 3e-85 -82.2 ((((..((((..((((((((.(((((((((..((((((((((....(((((.((...)).)))))....(((((((((((..(((......)))..)))))).)))))......))))))))))..))))))))).))))))))..))))..)))) (-82.20)