mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGCCAAGGATGACTTGCCGG GGCAAGTCTGTCCTTGGCTACA ATGAGGTAGAGAACGGGATGCAGCCAAGGATGACTTGCCGGCTCCTGGAACCTGGAGGCGTCTCAGCTTGCTGTGCTGTGGCTTAGAACTTAGTCGGCAAGTCTGTCCTTGGCTACACCTAGTTCTCTTCCTCT 2 1 5' arm Zea_mays pmrd MIR169_2 6e-62 zma-MIR169c 4e-72 -72.1 ..((((.((((((((((.((.(((((((((((((((((((.((((.(....).))))..(((.((((.......)))).)))............))))))))).)))))))))).))))).))))))).)))). (-72.10)