mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCCAAGGATGACTTGCCTG GGCAGTCTCCTTGGCTAGCC GATGAGAGTGGTAGCTCTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGTGTGCTGGCCACGCTCCCCTCATGCAAGGACCATCTCGTGTCGACCGACGAGCGAGCGAGCGATCGATCGATGAGAGGATGACGAAGCTTGGGGTGTACGTTGGTCTCTCACGGGCAGTCTCCTTGGCTAGCCCTGACTCACTCTTACCG 0 3 5' arm Zea_mays pmrd MIR169_5 0.00000000005 zma-MIR169i 5e-106 -85.1 (.((((((((..((.((.((((((((((((.((((.(((((((.(..(((((((..(.(((((.((..(...((((((..(((((.(((((..(....)..)).))).)))))..)).)))).)...)).))))).)..)).))))).).)))))))))))))))))))).)))..)))))))))))).). (-85.10)