mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGCCAAGGATGACTTGCCGG GGCAAGTCTGTCCTTGGCTA CAGCCAAGGATGACTTGCCGGCTCCTGGAACCTGGAGGCGTCTCAGCTTGCTGTGCTGTGGCTTAGAACTTAGTCGGCAAGTCTGTCCTTGGCTA 2 1 5' arm Zea_mays pmrd MIR169_2 9e-48 zma-MIR169c 5e-49 -50.2 .(((((((((((((((((((.((((.(....).))))..(((.((((.......)))).)))............))))))))).)))))))))). (-50.20)