mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGCCAAGGATGACTTGCCGA GGCAAGTTGTTCTTGGCTA CAGCCAAGGATGACTTGCCGATCTATCGTCGATCAACGAGCGACGCCTCTGATGTCTGATCTCGACATCTATCGTCGTCAGACCATCATCATCTATCGGCAAGTTGTTCTTGGCTA 3 0 5' arm Zea_mays pmrd MIR169_2 0.00003 zma-MIR169b 2e-61 -55.4 .(((((((((..((((((((((....(((((.((...)).)))))....(((((((((((..(((......)))..)))))).)))))......))))))))))..))))))))). (-55.40)