mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GATGTTGGCATGGCTCAATCA ATTGAGCCGTGCCAATATC GATGTTGGCATGGCTCAATCAACTCGCCGGCCGCGGGTGGCTTAGCTTATTAATTCTGCGCGTTCGATCGAGGTGCGGGCGCAGTGTTTAATTGATTGAGCCGTGCCAATATC 0 0 5' arm Zea_mays pmrd MIR171_1 3e-51 zma-MIR171f 1e-43 -56.3 (((((((((((((((((((((....((((.(....).)))).......(((((..((((((..(((((....)).)))))))))...)))))))))))))))))))))))))) (-56.30)