mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCCAAAGGGATCGCATTGATC TCAGTGCAATCCCTTTGGAAT ACTCCAAAGGGATCGCATTGATCTATTCTCACCTGCCGCCTGCTGGATGCGATGCGAGTCGACGACAAGATCAGTGCAATCCCTTTGGAAT 1 0 5' arm Zea_mays pmrd 100 zma-MIR393a 3e-44 -41 ..(((((((((((.((((((((((..((((..((..(((.(((.....)))..)))))..)).))..)))))))))).))))))))))).. (-41.00)