mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATGTGTGTGTGTATGTATAT ATATATATATATATATATATA GGTGGAGGATATATGTGTGTGTGTATGTATATATACACACTCAGGGTAGGACTGACAGCACCCAGGTATTGTCTTGTTCTTATGGGGTATATATATATATATATATATATATATATATAATTT CATGAATCACAGTTTATTTTAAACATATCATCTACAACTCATTAGTGTGCAGACTCCAGGCTAAAAATGGATTTCTCATCAACATTATTTCCATAAATAAAATACAATAAGCTTTCCAATTTAGGAACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTCTGTACAGTTAAAATAGCATATAAAACTCACAAACATTGCACGCTCTGGTACACAGCTAGGTATTCTGGGACTGTTCAGCTGCTGAATTCCAACTCCCACCATCTGGCAGGTTAAACATCATAGGCAGCTGGAAAGCCACTGTTTGCTTATTGTTACTGGACAATATGGGTGGAGGATATATGTGTGTGTGTATGTATATATACACACTCAGGGTAGGACTGACAGCACCCAGGTATTGTCTTGTTCTTATGGGGTATATATATATATATATATATATATATATATAATTTAATTTTTTTTCCCCCAACGCCATTTAAAATATTTACTGTTTTGATCAATTTGATATAGAAAACATGCATGTATATTACTCTCTCTAATATTTATAGGTGGATAGATAGATGATGGATGGATGGGTCGGTAGATGTGTGCACCTAACCATGGCTGCAACAAAAGATACTGTCAAGCCTCATTGCCCCCATATGAGCCCTAATAATTTATTTCGCAACACTTTTCTGCTTTCCAGACAATACAATGGATGCAGACTCA 0 0 5' arm Xenopus_tropicalis mirnest 100 mmu-mir-467g 0.0000004 -39.2 ........(((((((((((((((((((((((((((.((.((((....(((((.(((((.((....)).)))))..)))))..)))))).)))))))))))))))))))))))))))....... (-39.2)