mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATGTATGTATGCATGTATGTA TGTACGCAGCACTGTACAGTA TAGTTTAGCACATGTATGTATGCATGTATGTATGTATAGCTTTACTTATAAGGGCTCTGGCACACGGGGAGATTAGTCGCCGGCGACTAATCTTTCTGTGTGCCAGAGCCCTAAAGCGCTACTTATGTACGCAGCACTGTACAGTAGAATACAT AATTTCCCATTTAAACAAGGATTTATTTACCGTGGATTTCTGTGGTTAAATGAGAGTACTGCAAAATGGCACAAACATATACCGCAATTGAATATTTTTCAAGAGTCTTAGGTAGATCTGTAAACTGTGGGAAAATGCAAAAAAAAAAAAAAAAATTGAGAGTACAAAGGTTTAACGCTTATAGGAATAAATAAGCCTTATGATCCCTTTGCTTTTTGGTTTGGATTTTAGTTTAGCACATGTATGTATGCATGTATGTATGTATAGCTTTACTTATAAGGGCTCTGGCACACGGGGAGATTAGTCGCCGGCGACTAATCTTTCTGTGTGCCAGAGCCCTAAAGCGCTACTTATGTACGCAGCACTGTACAGTAGAATACATTAAAACAAGCTGGGGGTTATTAAGACAATAGATAAATACCAAGTATAACAATAAATACCAGATACAGTTGCCATAAGTTAAGAGTCAAAGACACAAGAGTATGGAGGTCCCTGCCCCGTAGAGCTTACAATCTATATGGGAGGGTAAAGGTCCCCATACACAAGGCGATTTCACTCGTTGTGCGACAAACGATTATATCGACAAACGATCGTATGGCGATCGGGTTTCCATACGATATGC 3 2 5' arm Xenopus_tropicalis mirnest Clostridiales-1 0.0001 100 -68.1 ..((((.((...((((((..(((.((((((((.(((..(((((.......(((((((((((((((((((((((((((((....))))))))))))))))))))))))))))))))))..))).))))))))..))).)))))))).)))).... (-68.1)