mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAAGGGGCATGCAGAGGAG TACCTGCTGCAGGGCTCATTTCACT TGGTAACCATCACTGAAATTTATACCTGCTGCAGGGCTCATTTCACTCACTAGTCGCTTCATGTACCATGTTTTTGTATAGCTTTCTGGAACAACTAAATGGACAGAGAGAGGTTGATTGATTCAATCGGGAAGTAGCAGTAGCGGTGGAAGGGGCATGCAGAGGAGAGGTCAAGATGGAGAGAAA CCCATAAAAAATCACTTGTTTTCCATGAGTTTTACTTATTGGAAGCAAGAAATGAAAAGCCACATTTCAAGCAAACAAAGAGCAAAGCAGTGAAATGAAAGAAAAAGGCAACCGCAGCTCCTGGTTTAGCATTCGCACAGCATTGCAATAAATAAAACATGCAAGTATTGACCTATAATGGAGGCTGACCTACAAGTTCAGCACTTTAAGCTTCTTTTCCTTTGCAAATGTGTCCCACTCAATGACTCGGCAAGCTGCTCCATCGTAAACAACATGCTTTGGCAGCTTTTTGCTGTGTGAAACAAGAGTTCCTCCATCCACCAGTGCCTTGCCGACTGCAGTGGCTTGGTAACCATCACTGAAATTTATACCTGCTGCAGGGCTCATTTCACTCACTAGTCGCTTCATGTACCATGTTTTTGTATAGCTTTCTGGAACAACTAAATGGACAGAGAGAGGTTGATTGATTCAATCGGGAAGTAGCAGTAGCGGTGGAAGGGGCATGCAGAGGAGAGGTCAAGATGGAGAGAAAGAAAGCGATATTTTTCATCTC 3 2 3' arm Elaeis_guineensis mirnest 100 bdi-MIR528 0.00000001 -51.1 ......(((((..(((..(((...(((.(((((..((((.(((((((.(((.((.(((((.(((((.........))))).(((((((...((......))..))))))).((((((.....))))))..))))).)))))...))))))).)))).)))))))).))).))).)))))....... (-51.1)