mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGGAACCTGACGGGCCTCCA GAAACCTGACGGGCCTCCAAA CCAGACTCGGTTGGGAACCTGACGGGCCTCCAAACGCTTGACTTGCGCGGGTGCTCCACTCTGCAGACGTTCCCAGACTCGGTTGGGAACCTGACGGGCCTCCAAACGCTTGACTTGAGCTGGTGGTCCACTCTGCAGACGCTCCCAGACTCGGTTGGAAACCTGACGGGCCTCCAAACGCTTGAC GTTGGGAACCTGACAGGCCTCCAAACGCTTCACTTGAATGGGTGCTCCACTCTGCAGACGCTCCCAGACTCGGTTGGGAACCTGATGGGCCTCCAAACGCTTGACTTGAGTTGGTGCTCCACTCTGCAGAGGCTCCCAGACTCGGTTGGGAACCTGACGGGCCTCCAAACGCTTCACTTGAGCCGGTGCTCCACTCTGCAGATGCTCCCAGACTCGGTTGGGAACTTGACAGGCCTCCAAACGCTTAACTTGAGCCTGTCCTCCACTCTACAGACGCTCCCAGACTCGGTTGGGAACCTGACGGGCCTCCAAACGCTTTACTTGCGCCGGTGCTCCACTATGCAGACGCTCCCAGACTCGGTTGGGAACCTGACGGGCCTCCAAACGCTTGACTTGCGCGGGTGCTCCACTCTGCAGACGTTCCCAGACTCGGTTGGGAACCTGACGGGCCTCCAAACGCTTGACTTGAGCTGGTGGTCCACTCTGCAGACGCTCCCAGACTCGGTTGGAAACCTGACGGGCCTCCAAACGCTTGACTTGAGCCGGTGCTCCACTCTGCAGACGCTCCCAAACTCGGTTGGGAACCTGACGGGCCTCCAAACGCTTGACTTGAGCGGGTGCTCCACTCTGCAGACGCTCCCAGACTCAGTTGGGAACCTGACGGGCCTCCAAACGCTTGACTTGAGCGGGTGCTCCACTCTGCAGACGCTCCCAGACTCGGTTGGGAACCTGACGGGCCTCCAAACGCTTGACTTGAGCAAGTGCTCCAATTTACATATGTTGACCAATATTGAGCATTTGAGCTCATTGGAGAAGCTTAATGTGAAGCAATGTCCCAAACTGCAATGGGGCTCGGAAGTAATTGAGCAGCTGCGCCAACGACTGGGAGAAGGCTTCATGGAAGCATGCGAGTTGGAAGTTTCATAATTACAATTGTAAAATATAGAAATGGAAGTTTCATAATTACAATTGTGGTCAGGTGGCGACAGTGTTCACTGCACGCTACATACAGAGCCGTATCATTAACCTTCAAAAGTATGTGATCACAAGCAAAATGAATTGTAAAAAATGGTTCCTCTACCTTTCATTCCCGTTTTAATAATT 5 0 5' arm Picea_glauca mirnest 100 pta-MIR1315 4e-39 -59.9 .(((...((.(((((..((((.((((..(((((.....(((.((....(((.((.....((((((((.((((((((......)))))))).....(((((.(((...((((.....))))))).)))))..)))))))).)).))).)).))).)))))..)))).))))..))))).)).))).. (-59.9)