mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GCTCTCTATGCTTCTGTCATC TGACAGAAGATAGAGAGCAC ATGCTGTTGACAGAAGATAGAGAGCACAGATGATGACATGCAAGACCCATTGCATCTCACTCCTTTGTGCTCTCTATGCTTCTGTCATCACCT CTCTTTTTATATACATATTTCCTAGTCTAGCTAATTCCCTTTGTTGATCTGTTTCTCTAGATTATATATGCTAGCTTGTTGTTAGCAAGAGGCAAAGGAGGCATGTGGTGATGCTGTTGACAGAAGATAGAGAGCACAGATGATGACATGCAAGACCCATTGCATCTCACTCCTTTGTGCTCTCTATGCTTCTGTCATCACCTTCAGCCTCTTGCTGAATCCACCTTAATTAGTTCTCGAATGATCCCCTTTTTTTTTTTTATGAAAGTTCTCTAATGATTTCACCATGCTAATCTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCAGACTACCTCGAGAAAGACTTTGATGGAATGCTGGAGCAGTAGTTTCAGAGATTTGCTTTGTTTTGGCTCCTATTTGGTTTTCCATGTCAACCGCTTGTAACTGGGTATCATGTTCAGCTTTAGCTATCGTGCAAGTTTCTGATACAACGACAATCTCAAGTTACTGAGGCTAACCCCTCGCCAGCAACATATTTCCAGACCCGATATTAATTTCCAATCTACTACTAC 1 1 3' arm Elaeis_guineensis mirnest 100 vvi-MIR156i 1e-27 -44.4 ....((.(((((((((((((((((((((((.(((((.((((((......)))))).))).)).)))))))))))))).))))))))).))... (-44.4)