mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAAACCTGACGGGCCTCCA GGAACCTGACGGGCCTCCAAA CAGACTCGGTTGGGAACCTGACGGGCCTCCAAACGCTTGACTTGCGCGGGTGCTCCACTCTGCAGACGTTCCCAGACTCGGTTGGGAACCTGACGGGCCTCCAAACGCTTGACTTGAGCTGGTGGTCCACTCTGCAGACGCTCCCAGACTCGGTTGGAAACCTGACGGGCCTCCAAACGCTTGA GTTGGGAACCTGACAGGCCTCCAAACGCTTCACTTGAATGGGTGCTCCACTCTGCAGACGCTCCCAGACTCGGTTGGGAACCTGATGGGCCTCCAAACGCTTGACTTGAGTTGGTGCTCCACTCTGCAGAGGCTCCCAGACTCGGTTGGGAACCTGACGGGCCTCCAAACGCTTCACTTGAGCCGGTGCTCCACTCTGCAGATGCTCCCAGACTCGGTTGGGAACTTGACAGGCCTCCAAACGCTTAACTTGAGCCTGTCCTCCACTCTACAGACGCTCCCAGACTCGGTTGGGAACCTGACGGGCCTCCAAACGCTTTACTTGCGCCGGTGCTCCACTATGCAGACGCTCCCAGACTCGGTTGGGAACCTGACGGGCCTCCAAACGCTTGACTTGCGCGGGTGCTCCACTCTGCAGACGTTCCCAGACTCGGTTGGGAACCTGACGGGCCTCCAAACGCTTGACTTGAGCTGGTGGTCCACTCTGCAGACGCTCCCAGACTCGGTTGGAAACCTGACGGGCCTCCAAACGCTTGACTTGAGCCGGTGCTCCACTCTGCAGACGCTCCCAAACTCGGTTGGGAACCTGACGGGCCTCCAAACGCTTGACTTGAGCGGGTGCTCCACTCTGCAGACGCTCCCAGACTCAGTTGGGAACCTGACGGGCCTCCAAACGCTTGACTTGAGCGGGTGCTCCACTCTGCAGACGCTCCCAGACTCGGTTGGGAACCTGACGGGCCTCCAAACGCTTGACTTGAGCAAGTGCTCCAATTTACATATGTTGACCAATATTGAGCATTTGAGCTCATTGGAGAAGCTTAATGTGAAGCAATGTCCCAAACTGCAATGGGGCTCGGAAGTAATTGAGCAGCTGCGCCAACGACTGGGAGAAGGCTTCATGGAAGCATGCGAGTTGGAAGTTTCATAATTACAATTGTAAAATATAGAAATGGAAGTTTCATAATTACAATTGTGGTCAGGTGGCGACAGTGTTCACTGCACGCTACATACAGAGCCGTATCATTAACCTTCAAAAGTATGTGATCACAAGCAAAATGAATTGTAAAAAATGGTTCCTCTACCTTTCATTCCCGTTTTAATAATT 5 0 3' arm Picea_glauca mirnest 100 pta-MIR1315 4e-39 -59.6 (((...((.(((((..((((.((((..(((((.....(((.((....(((.((.....((((((((.((((((((......)))))))).....(((((.(((...((((.....))))))).)))))..)))))))).)).))).)).))).)))))..)))).))))..))))).)).))). (-59.6)