mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATTGCACTTGTCCCGGCCTG GGTTGGGATTGGTTGCAATGCT CTTTCTGTATAGGTTGGGATTGGTTGCAATGCTGTACTATTTATGTAGTATTGCACTTGTCCCGGCCTGTTTAGGAT TGTGGGATGGTGGGGAGTTGCCCCTTTCTGTATAGGTTGGGATTGGTTGCAATGCTGTACTATTTATGTAGTATTGCACTTGTCCCGGCCTGTTTAGGATGCTTGGGATTATCAAATGGTTTATGCATTCCGACTTTATTTTTTCCCTTTATTTGTTAAAAATGTCATTAGTCCATGGAAGTACTTGTCTTAACTTTGTAATTTATTGCTGCTTATTTATGTATATGGAACAACAATGTAATTATAAAATCAATAT 1 1 3' arm Xenopus_tropicalis mirnest mir-92 0.00000002 xla-mir-92a-1 2e-38 -33.1 ..(((((.((((((((((((.(((.(((((((((...........)))))))))))).)))))))))))).))))). (-33.1)